Ekstrakulikuler Karate menjadi salah satu dari sekian banyak pilihan eksrakulikuler di Azhari Jepara. Ekstrakulikuler ini bertujuan untuk mengembangkan hobi, minat, dan bakat siswa pada olahraga bela diri. Dalam ekstra ini, kita tidak hanya diajarkan cara-cara menyerang, tapi juga dalam hal mempertahankan diri dari serangan lawan, termasuk melatih konsentrasi diri. Berdirinya ekstra ini dilatar belakangi oleh banyaknya siswa yang terlibat perkelahian satu sama lain.

Dengan di didirikannya ekstra karate, terbukti perkelahian yang dulu sering terjadi antar siswa semakin berkurang. Hingga kini terbukti ekstra karate terus mewujudkan keamanan dan ketentraman antar siswanya. Kedepannya, sangat diharapkan bahwa ekstra ini dapat menjadi wadah penyaluran energi positif untuk para siswa.